MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 32005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020411	TA	3	6	95	100	50 %	50 %	0 %	0 %	452943220
2	NC_020411	A	7	7	135	141	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
3	NC_020411	T	6	6	165	170	0 %	100 %	0 %	0 %	452943220
4	NC_020411	TCAAA	2	10	186	195	60 %	20 %	0 %	20 %	452943220
5	NC_020411	A	7	7	193	199	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
6	NC_020411	TTG	2	6	238	243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943220
7	NC_020411	A	7	7	252	258	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
8	NC_020411	A	6	6	578	583	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
9	NC_020411	AAG	2	6	598	603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943220
10	NC_020411	TCT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943220
11	NC_020411	TAG	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943220
12	NC_020411	TA	4	8	701	708	50 %	50 %	0 %	0 %	452943220
13	NC_020411	TA	3	6	719	724	50 %	50 %	0 %	0 %	452943220
14	NC_020411	CAA	2	6	770	775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943220
15	NC_020411	CT	3	6	782	787	0 %	50 %	0 %	50 %	452943220
16	NC_020411	GAA	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943220
17	NC_020411	TA	4	8	800	807	50 %	50 %	0 %	0 %	452943220
18	NC_020411	TAT	2	6	840	845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452943220
19	NC_020411	ATA	2	6	861	866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943220
20	NC_020411	AG	3	6	873	878	50 %	0 %	50 %	0 %	452943220
21	NC_020411	GAT	2	6	909	914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943220
22	NC_020411	ACA	2	6	985	990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943220
23	NC_020411	GCGA	2	8	1005	1012	25 %	0 %	50 %	25 %	452943220
24	NC_020411	GGT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943220
25	NC_020411	TGG	2	6	1078	1083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943220
26	NC_020411	A	6	6	1126	1131	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
27	NC_020411	TA	3	6	1173	1178	50 %	50 %	0 %	0 %	452943220
28	NC_020411	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452943220
29	NC_020411	AAC	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943220
30	NC_020411	AG	3	6	1203	1208	50 %	0 %	50 %	0 %	452943220
31	NC_020411	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943220
32	NC_020411	AC	3	6	1339	1344	50 %	0 %	0 %	50 %	452943220
33	NC_020411	A	7	7	1371	1377	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
34	NC_020411	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943220
35	NC_020411	A	6	6	1434	1439	100 %	0 %	0 %	0 %	452943220
36	NC_020411	AG	3	6	1617	1622	50 %	0 %	50 %	0 %	452943220
37	NC_020411	GATT	2	8	1638	1645	25 %	50 %	25 %	0 %	452943220
38	NC_020411	AT	3	6	1666	1671	50 %	50 %	0 %	0 %	452943221
39	NC_020411	T	7	7	1713	1719	0 %	100 %	0 %	0 %	452943221
40	NC_020411	A	6	6	1762	1767	100 %	0 %	0 %	0 %	452943221
41	NC_020411	CCAC	2	8	1768	1775	25 %	0 %	0 %	75 %	452943221
42	NC_020411	GTT	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943221
43	NC_020411	TACC	2	8	1850	1857	25 %	25 %	0 %	50 %	452943221
44	NC_020411	AAG	2	6	1908	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943221
45	NC_020411	A	6	6	1927	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	452943221
46	NC_020411	A	7	7	1947	1953	100 %	0 %	0 %	0 %	452943221
47	NC_020411	A	6	6	1971	1976	100 %	0 %	0 %	0 %	452943221
48	NC_020411	A	6	6	1993	1998	100 %	0 %	0 %	0 %	452943221
49	NC_020411	CTT	2	6	2015	2020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943221
50	NC_020411	CTTT	2	8	2030	2037	0 %	75 %	0 %	25 %	452943221
51	NC_020411	AGCTAT	2	12	2061	2072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452943221
52	NC_020411	CAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943221
53	NC_020411	TAG	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943221
54	NC_020411	TAT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452943221
55	NC_020411	CTT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943221
56	NC_020411	TGAAA	2	10	2204	2213	60 %	20 %	20 %	0 %	452943221
57	NC_020411	TAA	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943221
58	NC_020411	TCT	2	6	2287	2292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943221
59	NC_020411	AAGTA	2	10	2326	2335	60 %	20 %	20 %	0 %	452943221
60	NC_020411	ACC	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452943221
61	NC_020411	CCT	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452943221
62	NC_020411	AAAG	2	8	2374	2381	75 %	0 %	25 %	0 %	452943221
63	NC_020411	ATC	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943221
64	NC_020411	TC	3	6	2500	2505	0 %	50 %	0 %	50 %	452943222
65	NC_020411	ATACC	2	10	2521	2530	40 %	20 %	0 %	40 %	452943222
66	NC_020411	CAT	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943222
67	NC_020411	TA	3	6	2569	2574	50 %	50 %	0 %	0 %	452943222
68	NC_020411	T	7	7	2584	2590	0 %	100 %	0 %	0 %	452943222
69	NC_020411	CTC	2	6	2600	2605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452943222
70	NC_020411	TGT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943222
71	NC_020411	T	6	6	2644	2649	0 %	100 %	0 %	0 %	452943222
72	NC_020411	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943222
73	NC_020411	AAGC	2	8	2725	2732	50 %	0 %	25 %	25 %	452943222
74	NC_020411	TCT	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943222
75	NC_020411	TTC	2	6	2765	2770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943222
76	NC_020411	GGTG	2	8	2897	2904	0 %	25 %	75 %	0 %	452943223
77	NC_020411	TCA	2	6	3013	3018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943223
78	NC_020411	CA	3	6	3017	3022	50 %	0 %	0 %	50 %	452943223
79	NC_020411	GT	3	6	3043	3048	0 %	50 %	50 %	0 %	452943223
80	NC_020411	AT	4	8	3061	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	452943223
81	NC_020411	AT	3	6	3091	3096	50 %	50 %	0 %	0 %	452943223
82	NC_020411	T	6	6	3117	3122	0 %	100 %	0 %	0 %	452943223
83	NC_020411	ATACAC	2	12	3243	3254	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	452943223
84	NC_020411	TGG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943223
85	NC_020411	TGA	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943223
86	NC_020411	CTG	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452943223
87	NC_020411	ACATA	2	10	3335	3344	60 %	20 %	0 %	20 %	452943223
88	NC_020411	AGA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943223
89	NC_020411	T	6	6	3443	3448	0 %	100 %	0 %	0 %	452943223
90	NC_020411	GTAA	2	8	3486	3493	50 %	25 %	25 %	0 %	452943223
91	NC_020411	AC	3	6	3495	3500	50 %	0 %	0 %	50 %	452943223
92	NC_020411	CAAA	2	8	3513	3520	75 %	0 %	0 %	25 %	452943223
93	NC_020411	A	7	7	3667	3673	100 %	0 %	0 %	0 %	452943223
94	NC_020411	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	452943223
95	NC_020411	CTC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452943223
96	NC_020411	GCA	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452943223
97	NC_020411	CAAAA	2	10	3751	3760	80 %	0 %	0 %	20 %	452943223
98	NC_020411	TTGAT	2	10	3766	3775	20 %	60 %	20 %	0 %	452943223
99	NC_020411	ATT	3	9	3838	3846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452943223
100	NC_020411	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943223
101	NC_020411	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943223
102	NC_020411	A	6	6	4167	4172	100 %	0 %	0 %	0 %	452943223
103	NC_020411	GAA	2	6	4240	4245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943223
104	NC_020411	TA	3	6	4257	4262	50 %	50 %	0 %	0 %	452943223
105	NC_020411	TGA	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943223
106	NC_020411	GAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943224
107	NC_020411	TGC	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452943224
108	NC_020411	ACA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943224
109	NC_020411	ACA	2	6	4620	4625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943224
110	NC_020411	AGA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943224
111	NC_020411	ATA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943224
112	NC_020411	CTA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943224
113	NC_020411	TCT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943224
114	NC_020411	AAGA	2	8	4855	4862	75 %	0 %	25 %	0 %	452943224
115	NC_020411	GAA	2	6	4934	4939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943224
116	NC_020411	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943224
117	NC_020411	CAT	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943224
118	NC_020411	CAAAC	2	10	5047	5056	60 %	0 %	0 %	40 %	452943224
119	NC_020411	AAT	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943224
120	NC_020411	A	6	6	5198	5203	100 %	0 %	0 %	0 %	452943224
121	NC_020411	TAT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452943224
122	NC_020411	A	6	6	5392	5397	100 %	0 %	0 %	0 %	452943224
123	NC_020411	CTA	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943224
124	NC_020411	AT	3	6	5559	5564	50 %	50 %	0 %	0 %	452943225
125	NC_020411	AAG	2	6	5729	5734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943225
126	NC_020411	GA	3	6	5754	5759	50 %	0 %	50 %	0 %	452943225
127	NC_020411	A	7	7	5770	5776	100 %	0 %	0 %	0 %	452943225
128	NC_020411	T	6	6	5825	5830	0 %	100 %	0 %	0 %	452943225
129	NC_020411	AGAA	2	8	5864	5871	75 %	0 %	25 %	0 %	452943225
130	NC_020411	AGA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943225
131	NC_020411	GTT	2	6	5899	5904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943225
132	NC_020411	TA	3	6	5907	5912	50 %	50 %	0 %	0 %	452943225
133	NC_020411	CTT	2	6	5934	5939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943225
134	NC_020411	ATG	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943225
135	NC_020411	TGT	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943225
136	NC_020411	AGA	2	6	5993	5998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943225
137	NC_020411	CTT	2	6	6013	6018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943225
138	NC_020411	A	6	6	6054	6059	100 %	0 %	0 %	0 %	452943225
139	NC_020411	GAA	2	6	6096	6101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943225
140	NC_020411	GGT	3	9	6116	6124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943225
141	NC_020411	AGA	2	6	6128	6133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943225
142	NC_020411	AT	3	6	6142	6147	50 %	50 %	0 %	0 %	452943225
143	NC_020411	AT	3	6	6261	6266	50 %	50 %	0 %	0 %	452943226
144	NC_020411	T	6	6	6301	6306	0 %	100 %	0 %	0 %	452943226
145	NC_020411	GTT	2	6	6401	6406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943226
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147	NC_020411	TAAT	2	8	6431	6438	50 %	50 %	0 %	0 %	452943226
148	NC_020411	ATC	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943226
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154	NC_020411	TCT	2	6	6845	6850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943226
155	NC_020411	TATT	2	8	7026	7033	25 %	75 %	0 %	0 %	452943226
156	NC_020411	TA	3	6	7051	7056	50 %	50 %	0 %	0 %	452943226
157	NC_020411	CTA	2	6	7068	7073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943226
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161	NC_020411	ATCT	2	8	7195	7202	25 %	50 %	0 %	25 %	452943226
162	NC_020411	GGT	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452943226
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170	NC_020411	TAG	2	6	7721	7726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943227
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175	NC_020411	GTTTA	2	10	8228	8237	20 %	60 %	20 %	0 %	452943227
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249	NC_020411	A	6	6	13644	13649	100 %	0 %	0 %	0 %	452943232
250	NC_020411	ACA	2	6	13856	13861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943232
251	NC_020411	AAAGAT	2	12	13881	13892	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	452943232
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256	NC_020411	TTTG	2	8	14133	14140	0 %	75 %	25 %	0 %	452943232
257	NC_020411	CTGT	2	8	14161	14168	0 %	50 %	25 %	25 %	452943233
258	NC_020411	ATC	2	6	14169	14174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943233
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262	NC_020411	AGG	2	6	14312	14317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452943233
263	NC_020411	ATA	2	6	14354	14359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452943233
264	NC_020411	TCT	2	6	14379	14384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452943233
265	NC_020411	TA	3	6	14391	14396	50 %	50 %	0 %	0 %	452943233
266	NC_020411	TTG	2	6	14433	14438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943233
267	NC_020411	AAG	2	6	14449	14454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452943233
268	NC_020411	GTT	3	9	14462	14470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943233
269	NC_020411	AGG	2	6	14597	14602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452943233
270	NC_020411	AGT	2	6	14653	14658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943233
271	NC_020411	TC	3	6	14683	14688	0 %	50 %	0 %	50 %	452943233
272	NC_020411	TA	3	6	14713	14718	50 %	50 %	0 %	0 %	452943233
273	NC_020411	CAA	2	6	14758	14763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452943233
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278	NC_020411	TTGG	2	8	14977	14984	0 %	50 %	50 %	0 %	452943233
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285	NC_020411	TA	3	6	15144	15149	50 %	50 %	0 %	0 %	452943233
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288	NC_020411	ACT	2	6	15182	15187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943233
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392	NC_020411	TGATA	2	10	20475	20484	40 %	40 %	20 %	0 %	452943239
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396	NC_020411	TTG	2	6	20569	20574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452943239
397	NC_020411	TA	3	6	20596	20601	50 %	50 %	0 %	0 %	452943239
398	NC_020411	GTA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452943239
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400	NC_020411	CAT	2	6	20703	20708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452943239
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